温州医科大学是浙江省省属普通高等学校，2015年成为浙江省人民政府、国家卫生计生委和教育部共建高校，是全国首批硕士学位授予单位，具有博士学位授予权。现有临床医学一级学科博士点，8个一级学科硕士点，6个专业硕士学位授权点，设有临床医学一级学科博士后科研流动站。现有1个国家工程技术研究中心、1个省部共建国家重点实验室培育基地和12个省部级重点实验室（研究中心），有2个浙江省“重中之重一级学科”、1个浙江省“2011协同创新中心”和10个浙江省重点学科。

学校有33个本科专业，涉及医学、理学、工学、管理学、文学、法学、教育学等七大学科门类。目前有全日制在校生15940余人，其中博士研究生107人，硕士研究生2740余人，学历教育留学生690余人。学校现有教职员工及医护人员9350余人（含附属医院），其中具有高级专业技术职务1600余人。学校本部现有专任教师1350余人，其中具有正高级专业技术职务333人，具有副高级专业技术职务427人。

近年来，学校承担省部级以上科研项目1530余项，其中国家级科研项目630余项，科研成果获得省部级以上奖励50余项，其中获国家科技进步奖二等奖4项（3项排名第一，1项排名第二）、国家技术发明奖二等奖1项、中华医学科技奖一等奖3项、中国药学会科技奖一等奖1项、浙江省科学技术奖一等奖8项。

学校拥有5所附属医院，其中4所为三级甲等医院，同时在浙江省各地设有17所非直管附属医院（临床学院）。

学校常年面向海内外诚聘各类人才，近年来受聘的高层次人才中有40余人入选国家或浙江省“千人计划”。有20人入选国家“万人计划”、“长江学者奖励计划”、国家“百千万人才工程”、国家有突出贡献中青年专家、教育部“新世纪优秀人才支持计划”、国家卫生计生委有突出贡献的中青年专家、省特级专家、省“千人计划”、省高校特聘教授等。